党委领导下的校长负责制是我国大学的根本制度，这一制度是富有中国特色的、高效的大学治理体系。作为我国高校领导体制探索的结果，符合我国高等教育发展的规律。新时代新征程上，高校要落实好“为党育人、为国育才”的根本任务，必须在实践中不断深化对党委领导下校长负责制的认识。
加强党对高校全面领导的逻辑起点。党的领导是中国特色社会主义的最本质特征。站在“两个一百年”奋斗目标的历史交汇点上，我们一定要坚定不移地坚持和加强党对高校的全面领导，确保党的教育方针政策和党中央决策部署扎扎实实地在高校贯彻落实下去。在具体的实践过程中，坚持党的领导要切切实实在尊重高等教育发展规律的基础之上注重发挥好民主管理的作用，将民主参与、民主决策、民主监督作为加强党委集体领导的重要形式，做好党政合理分工，有条不紊地开展好教学、科研以及公共服务等各项工作。
我国大学的根本政治属性是中国领导的社会主义大学。坚持党对高等教育的领导，能保证我国大学的社会主义办学方向，能够从根本上解决大学为谁服务的问题。党委领导下的校长负责制是办好社会主义大学的独特优势。当前我国高校意识形态领域形势依然严峻，坚持和完善党委领导下的校长负责制才可能正真的保证我们党在高校意识形态领域的领导权和主动权，才可能正真的保证坚持马克思主义指导地位，教育引导学生旗帜鲜明地各种错误思想。
新时代高校完成历史使命的必然要求。立足新时代的历史方位，面对世界百年未有之大变局和中华民族伟大复兴的战略全局，大国之间综合国力的角逐与竞争，其实质是科技与人才的竞争。没有强大的科学技术创新实力作为支撑，就只能处于产业链、价值链的低端。高等教育是衡量一个国家发展水平和潜力的重要标志之一。当前，我们前所未有地接近实现中华民族伟大复兴的宏伟目标，对科学知识、优秀人才的渴求程度可谓是前所未有的紧迫。教育兴则国家兴，教育强则国家强。立足新时代，我国高等教育必须明确高校培养什么样的人、如何培养人以及为谁培养人的关键性问题，抓好培养社会主义建设者和接班人这个根本，心怀国之大者，为服务国家富强、民族振兴、人民幸福提供源源不断的人才供给。党委领导下的校长负责制为高校全面贯彻党的教育方针，保证社会主义办学方向，培养中国特色社会主义事业的合格建设者和可靠接班人，提供了根本制度保障。
破解高校自身发展难题的现实依据。通过梳理之前公布的31所中管高校的巡视反馈，均提到高校在执行党委领导下的校长负责制方面存在某些特定的程度的不足，除了对于该制度的认识和理解不到位之外，巡视意见多涉及党委领导下的校长负责制“执行”和“落实”层面存在的问题。此外，在31所高校巡视意见中，有多所高校进一步阐明了党委领导下的校长负责制存在机制不健全、机制落实不到位、机制落实效率不高等问题。党委领导下的校长负责制现存问题，要进一步解决和完善。
在新时代贯彻落实好党委领导下的校长负责制，要坚持“内外结合”的原则，既要有外部“推力”，即高校主管部门的指导和督促，又要有高校内部自身的“动力”，即高校领导班子自身体系建设的加强。做到两者的有机结合，才可以更好的促进制度的落地生效。
以制度建设为抓手，形成全过程闭环管理。要完善以决策程序为核心的制度体系。要着力构建党政领导班子成员务虚研讨、党委全委会和常委会研究决策、校长办公会议组织落实的议事决策体系。对于高校党委全会、常委会、校长办公会，其决策范围和程序能进行进一步规范。在工作中把握好相关程序和具体细节。加强工作机制建设，如通过党群工作会议制度、院（部、处）长联席会议制度等部署工作，通过发挥专门工作委员会、专项工作领导小组作用进行重要议题充分酝酿，通过健全督查督办机制进行过程监督，形成层级清晰、规范统一的现代大学制度体系。党委组织行政、学术委员会、教代会、各工作委员会、工会、共青团等横向沟通协商，充分发扬民主；通过完善并贯彻落实院（系）党组织会议、党政联席会议议事规则，党支部“三会一课”制度，实现纵向贯通，既高效部署落实工作，又反馈基层意见，从制度上保证横纵贯通的工作机制。此外，要建立科学有效的评价督导体系。尝试建立关于党委领导下的校长负责制贯彻执行水平的专项考核机制，重在日常的评价督导，利于及时有效地发现问题并进行督导提醒。同时，建立专项任务考核机制，围绕某个特定时期特定任务，就班子的工作开展情况做考核评价等。上级部门还要对高校领导班子和成员个人考核制度来优化，扩大评价主体，使年度考核及任职考核等考核结果更具科学性。
以政治建设为统领，持续加强领导班子建设。落实好党委领导下的校长负责制要格外的重视高校党委自身的作用。高校加强领导班子建设，书记校长作为“局中人”“引领者”，更是要起到模范带头作用。高校要坚持以政治建设为统领，高校党委要从做到“两个维护”、履行好政治责任的高度，理解并落实党委领导下的校长负责制，将“两个维护”落实到高校办学每个方面，切实强化政治意识和政治规矩，坚决反对工作中的分散主义、自由主义、本位主义等，为坚持和加强党对高校的全面领导提供坚强的制度保证。我们要深入学习习关于教育的重要论述，全面贯彻落实党的教育方针，完善党对高校全面领导的制度体系，加强督查问效，确保党中央决策部署和上级工作要求切实高效的在学校落地生根。
制度的执行关键在人，核心在于领导班子。高校落实党委领导下的校长负责制要注重选配好高校领导班子，特别是对于书记校长的选配。要用社会主义政治家、教育家的标尺来衡量，用新时期“好干部”的标准来遴选书记校长。落实好党委领导下的校长负责制，必须建设一个和谐团结、具有凝聚力和向心力的领导集体。按照民主集中制原则，建立和完善学校党政沟通协调、决策以及监督机制。凡属学校发展中的重大问题、重大决策，书记与校长之间要充分沟通酝酿、达成共识，并提交党政联席会议讨论决定，在集中集体智慧的基础上作出科学决策。校领导班子要善于用好各种方式，不断的提高团队建设成效。要用好理论中心组学习等形式，提高班子和成员政治判断力、政治领悟力、政治执行力。通过召开民主生活会，认真地开展批评与自我批评，以达到团结、巩固提高的目的，使班子更具战斗力、向心力。领导班子成员之间要相互理解、相互支持、密切配合、形成合力。根据任务分工，聚焦重点、难点，增强工作的主动性、积极性，强化统筹协调作用，配合校领导协同组织推进，并明确职责权限，制定工作流程，确保高效协同的开展各项工作。